Kāpēc NGS ir labāks par Sangeru?
Kāpēc NGS ir labāks par Sangeru?

Video: Kāpēc NGS ir labāks par Sangeru?

Video: Kāpēc NGS ir labāks par Sangeru?
Video: AMAZFIT GTR2e Smart Watch 5ATM: Things To Know // Accuracy Challenge 2024, Novembris
Anonim

Parauga lielums

NGS ir ievērojami lētāks, ātrāks, nepieciešams ievērojami mazāk DNS un ir vairāk precīzs un uzticams nekā Sanger sekvencēšana. Paskatīsimies uz šo vairāk cieši. Priekš Sanger sekvencēšana, katram nolasījumam ir nepieciešams liels daudzums veidnesDNS

Cilvēki arī jautā, kādas ir nākamās paaudzes sekvencēšanas priekšrocības?

Katram ir specifisks priekšrocības kritērijiem: lasīšanas garums, precizitāte, izpildes laiks un caurlaidspēja. Papildus DNS sekvenču analīzei, progresēšana sekvencēšana tehnoloģiju rezultātā ir analizēti citi bioloģiskie komponenti, piemēram, RNS un proteīns, kā arī to mijiedarbība sarežģītos šūnu tīklos.

Var arī jautāt, kāpēc Sangera sekvencēšana joprojām tiek izmantota? Sangera secība gadu gaitā uzlabota, lielāka daļa automatizācijas dēļ, un bija pamats sekvencēšana pirmais cilvēka genoms 2000. gadā. Tomēr mazāk nekā divu gadu desmitu laikā NGS ir apsteigusi Sangera secība pateicoties augstajai caurlaidspējai, paralēlai darbībai un daudz zemākām izmaksām.

Attiecīgi, kāda ir atšķirība starp Sangera sekvencēšanu un nākamās paaudzes sekvencēšanu?

Katrs iekļautais nukleotīds tiek identificēts pēc tā fluorescējošās marķējuma. Kritiskais atšķirība starp Sangersequencing un NGS ir sekvencēšana apjoms. Kamēr Sanger tikai metode sekvences vienu DNS fragmentu laikā, NGS ir masveidā paralēls, sekvencēšana miljoniem fragmentu vienlaicīgi vienā skrējienā.

Cik precīza ir Sangera sekvencēšana?

Sangera secība ar 99,99% precizitāte ir klīnisko pētījumu “zelta standarts”. sekvencēšana . Tomēr jaunākas NGS tehnoloģijas kļūst izplatītas arī klīnisko pētījumu laboratorijās, jo tām ir lielākas caurlaidspējas un zemākas izmaksas par paraugu.

Ieteicams: